Реєстр збитків було створено у відповідь на Резолюцію Генеральної Асамблеї ООН A/RES/ES-11/5 «Сприяння здійсненню правового захисту і забезпечення відшкодування шкоди у зв’язку з агресією проти України» від 14 листопада 2022 року , в якій Генеральна Асамблея визнала, що Росія має бути притягнута до відповідальності за порушення міжнародного права в Україні, в тому числі шляхом виплати репарацій. Резолюцією також визнано необхідність створення міжнародного репараційного механізму та рекомендовано як перший крок створити міжнародний реєстр збитків.
Реєстр збитків було створено під егідою Ради Європи Резолюцією CM/Res(2023)3, якою було укладено Розширену часткову угоду про Реєстр збитків, завданих агресією Російської Федерації проти України. Невід’ємним додатком Резолюції є Статут Реєстру збитків, який визначає мандат Реєстру збитків, його функції, структуру управління та порядок участі в ньому. Про створення Реєстру збитків було оголошено на IV Саміті глав держав та урядів Ради Європи , що відбувся у Рейк'явіку 16-17 травня 2023 року.
На сьогоднішній день до Реєстру приєдналися 43 держави та Європейський Союз.